《Cell》雜志以封面專輯形式發(fā)表了“溟淵計(jì)劃”(馬里亞納海溝環(huán)境與生態(tài)研究計(jì)劃,英文簡稱“MEER計(jì)劃”)第一階段研究成果。上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院/微生物代謝全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、深部生命國際研究中心主任肖湘教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì),依托我國自主研發(fā)的“奮斗者”號載人潛水器,在人類最少到達(dá)的極端環(huán)境——壓力高達(dá)1100個(gè)大氣壓的深淵極端環(huán)境下,實(shí)現(xiàn)了人類首次對深淵沉積物微生物及其生態(tài)過程的系統(tǒng)研究,向世界展現(xiàn)了一幅由中國科學(xué)家繪制的海洋最深生態(tài)系統(tǒng)圖。
研究成果以“Microbial?ecosystem?and?ecological?driving?forces?in?the?deepest?ocean?sediments”為題發(fā)表在《Cell》雜志上。百邁客生物為該研究提供了測序服務(wù)。

Microbial ecosystem and ecological driving forces in the deepest ocean sediments
研究背景
深淵區(qū)(水深超6,000米,或根據(jù)聯(lián)合國教科文組織定義為水深超過6500米)占海洋垂直深度的45%,以極端高壓(110兆帕)、低溫(接近冰點(diǎn))、黑暗及有機(jī)質(zhì)稀缺為特征。盡管環(huán)境嚴(yán)酷,這里卻孕育了獨(dú)特的生物群落,如凝膠狀魚類、端足類甲殼動(dòng)物及依賴化能合成的微生物。這些生物通過基因和代謝途徑的適應(yīng)性進(jìn)化,成為研究生命極限的范本。
從1960年起,人類對深淵的探索歷程一直伴隨著巨大的代價(jià)和犧牲,也為現(xiàn)代深淵研究奠定了基礎(chǔ)。直至中國“奮斗者號”全海深載人潛水器的出現(xiàn)(2020年創(chuàng)下10,909米下潛紀(jì)錄),深淵科考進(jìn)入新階段。其220公斤有效載荷、高速水聲通信系統(tǒng)及高國產(chǎn)化率,顯著提升了采樣精度與效率。
研究內(nèi)容及結(jié)果
構(gòu)建首個(gè)海洋最深生態(tài)系統(tǒng)圖景
上海交通大學(xué)肖湘團(tuán)隊(duì),作為全球深海高壓微生物領(lǐng)域極少數(shù)至今在研的科學(xué)團(tuán)隊(duì),與中國科學(xué)院深海科學(xué)與工程研究所等國內(nèi)多家科研單位共同參加了“奮斗者”號載人潛水器TS21航次,探索了馬里亞納海溝、雅浦海溝和菲律賓海盆6000-11000米水深區(qū)域,其中雅浦海溝最深點(diǎn)為人類首次探索,采集了包括水體、沉積物、宏生物、巖石等千余份樣本。
通過對采集的1,648份沉積物樣本進(jìn)行宏基因組測序,研究人員鑒定7,564個(gè)原核微生物物種,其中89.4%為未報(bào)道的新物種,這說明深淵微生物具有超乎想象的物種新穎性,盡管深淵調(diào)查區(qū)域的面積不足全球海洋的億分之一,其物種多樣性與已知的全球海洋微生物多樣性相當(dāng),說明在最深海域超高壓下微生物異常繁榮。
為解釋深淵微生物的異常繁榮,肖湘團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了一種新的基于宏基因組的生態(tài)分析流程,將環(huán)境生態(tài)驅(qū)動(dòng)過程與微生物基因組特征和代謝偏好結(jié)合起來,發(fā)現(xiàn)深淵微生物通過“精簡型”和“多能型”兩種截然不同的深淵環(huán)境適應(yīng)策略,支撐了高新穎性的微生物生態(tài)系統(tǒng)?;诖髷?shù)據(jù)對深淵微生物環(huán)境適應(yīng)的認(rèn)知,率先突破了國際深海高壓生命研究長達(dá)40年的瓶頸。

圖1.深淵微生物的超高新穎性和多樣性及其生態(tài)成因
構(gòu)建全球唯一的深淵微生物數(shù)據(jù)庫
“溟淵計(jì)劃”構(gòu)建的全球唯一的深淵微生物數(shù)據(jù)庫,總數(shù)據(jù)量與過去十年海洋微生物積累的總數(shù)據(jù)量相當(dāng),研究發(fā)現(xiàn)的深淵微生物出人意料的超高新穎性和多樣性,展現(xiàn)了深淵生命的新資源潛能,可能幫助人類解決當(dāng)前面臨的常規(guī)環(huán)境生物資源枯竭的困境。
“溟淵計(jì)劃”微生物數(shù)據(jù)集將依托國產(chǎn)數(shù)據(jù)庫向全球開放共享,呼吁國內(nèi)外研究學(xué)者協(xié)力攻堅(jiān)深淵環(huán)境與生命的重大科學(xué)問題,拓展人類對深部生命的認(rèn)知邊界。

圖2.全球唯一深淵微生物數(shù)據(jù)庫
該研究專題報(bào)道了深淵研究的重大進(jìn)展,樣本分析顯示出較高的分類新穎性,為我們呈現(xiàn)了一個(gè)海洋深處極度繁榮的生態(tài)系統(tǒng)。重點(diǎn)研究了深淵生態(tài)系統(tǒng),包括深淵微生物、深淵無脊椎動(dòng)物(鉤蝦)和深淵脊椎動(dòng)物(魚類)的特征與環(huán)境適應(yīng),從而描繪了深淵特殊的食物鏈:從微生物到鉤蝦再到魚類。發(fā)現(xiàn)了深淵存在跨越物種邊界的深淵環(huán)境“共適應(yīng)”策略。
以上內(nèi)容來源于上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院,侵刪


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